Хирургические кафедры Башкирского государственного медицинского университета, располагающиеся в различных клиниках города Уфы, являются основной движущей силой развития и внедрения новых технологий.
Кафедра общей хирургии (база РКБ им. Г.Г. Куватова)
Кафедра факультетской хирургии с курсом колопроктологии (база ГКБ № 21)
Кафедра госпитальной хирургии (база Клиника БГМУ, Кардиодиспансер)
Кафедра хирургических болезней и новых технологий (база ЖД больница, клиника БГМУ)
Кафедра хирургии с курсами эндоскопии и стационарозамещающих технологий ИДПО (база БСМП)
Кафедра хирургических болезней педиатрического и стоматологческого факультетов (база ГКБ №8)
Кафедра скорой помощи и медицины катастроф с курсами термической травмы и трансфузиологии (база ГКБ №18)